Disciplina Discipline IBI5013
Banco de Dados para Bioinformática

Databases for Bioinformatics

Área de Concentração: 95131

Concentration area: 95131

Criação: 20/11/2024

Creation: 20/11/2024

Ativação: 20/11/2024

Activation: 20/11/2024

Nr. de Créditos: 8

Credits: 8

Carga Horária:

Workload:

Teórica

(por semana)

Theory

(weekly)

Prática

(por semana)

Practice

(weekly)

Estudos

(por semana)

Study

(weekly)

Duração Duration Total Total
4 0 6 12 semanas 12 weeks 120 horas 120 hours

Docentes Responsáveis:

Professors:

João Eduardo Ferreira

Kelly Rosa Braghetto

Objetivos:

Introduzir conceitos de modelagem de bancos de dados para domínios de aplicação em bioinformática. Apresentar as principais abstrações de dados e suas representações e implementações em diferentes tipos de modelos de dados. Apresentar técnicas e ferramentas para a modelagem e implementação de fluxos de processamento de dados. Abordar práticas para o gerenciamento eficiente de grandes volumes de dados

Justificativa:

Tendo em vista a constante evolução semântica e tecnológica da representação e armazenamento da informação em bancos de dados, é fundamental o estudo e uso de técnicas e ferramentas de modelagem e implementação para o desenvolvimento de projetos de bancos de dados com qualidade para área de bioinformática.

Conteúdo:

Abstração de dados: classificação, composição, agregação e generalização. Projeto conceitual, lógico e físico de banco de dados estruturados. Bancos de dados ativos. Modelos multidimensionais de dados. Modelos de dados semiestruturados. Novas tecnologias para gerenciamento de dados (por exemplo, NoSQL e bancos de dados de grafos). Fluxos de processamento de dados. Bancos de dados de domínios de aplicação em bioinformática.

Forma de Avaliação:

Média ponderada de provas, exercícios e projetos.

Bibliografia:

1- R. Elmasri, S.B. Navathe, Fundamentals of Database Systems, 7th ed., Addison-Wesley, 2015. 2- C.J. Date, Introdução a Sistemas de Bancos de Dados, 8ª ed., Campus, 2004. 3- J.E. Ferreira, M. Finger, Controle de concorrência e distribuição de dados: a teoria clássica, suas limitações e extensões modernas, XII Escola de Computação, IME-USP, 2000. 4- A. Silberschatz, H.F. Korth, S. Sudarshan, Database System Concepts, 6th ed., McGraw-Hill, 2010. 5- C.A. Heuser, Projeto de Banco de Dados, 6ª ed., Bookman, 2008. 6- V.W. Setzer, F.C. Silva, Bancos de Dados: Aprenda o que são, melhore seu conhecimento, construa os seus, Edgar Blucher, 2005. 7- P.J. Sadalage, M. Fowler, NoSQL Distilled: A Brief Guide to the Emerging World of Polyglot Persistence, Addison Wesley, 2011. 8- M.T. Ozsu, P. Valduriez, Principles of Distributed Database Systems, 4th ed., Springer, 2020. 9- T. J. Teorey, Database Modeling and Design, 3nd. Ed., Morgan Kaufmann Publishers, Inc, San Francisco, 1999.

Bibliography:

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Tipo de oferecimento da disciplina:

Presencial

Class type:

Presencial