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Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto
 
Biologia
 
Disciplina: 5920921 - Evolução de Genes e Genomas
Evolution of Genes and Genomes

Créditos Aula: 4
Créditos Trabalho: 0
Carga Horária Total: 60 h
Tipo: Semestral
Ativação: 01/01/2017 Desativação:

Objetivos
Geral: Apresentar aos alunos de biologia as novidades mais recentes sobre como genes e genomas evoluem.
Específico: A disciplina pretende proporcionar aos graduandos em biologia uma visão atual, baseada nos avanços da genética molecular, das características do genoma eucarioto e dos mecanismos implicados na evolução de genomas e genes.
 
 
 
Docente(s) Responsável(eis)
1471547 - Maura Helena Manfrin
 
Programa Resumido
-Introdução ao estudo de genes e genomas
-Genomas: organização e diversidade
- Expressão e regulação gênica
- Replicação de genomas e mutação
- Mecanismos de origem de novos genes I: Duplicação e origem de famílias gênicas
- Mecanismos de origem de novos genes II: Elementos de transposição
- Mecanismos de origem de novos genes III: Transferência gênica lateral / Origem de novo
- Mecanismos de origem de novos genes VI: Shuffling: éxons, domínios e genes
- Evolução de genomas organelares: Cloroplasto / Mitocôndria
- Reconstrução de filogenia com dados moleculares I: Máxima Parcimônia e Máxima Verossimilhança
- Reconstrução de filogenia com dados moleculares II: Inferência Bayesiana
- Aplicações da filogenia molecular para o estudo da evolução de genes	
 
 
 
Programa
Genoma nuclear (procarioto e eucarioto): variação do tamanho, organização e diversidade. Expressão e regulação gênica. Evolução do mecanismo de replicação e mutação. Mecanismos de evolução de genomas e genes. (duplicação gênica, elementos de transposição, transferência lateral gênica, origem de novo, éxon shuffling, fusão e fissão de genes): evidências a partir de análises experimentais e computacionais. Origem de famílias gênicas. Evolução de genomas organelares (cloroplasto e mitocôndria). Modelos de genética de população para o destino de genes duplicados. Reconstrução de filogenias com dados moleculares (métodos da máxima parcimônia, geométricos e probabilísticos). Aplicações da filogenia molecular para o estudo da evolução de genes. 
 
 
 
Avaliação
     
Método
Aulas expositivas auxiliadas por recursos áudio-visuais, seminários, aulas práticas de bioinformática.
Critério
A média aritmética final será deduzida das notas de avaliação de duas provas teóricas, PT1 e PT2, com peso 2, e média aritmética dos relatórios de aulas práticas e seminários com peso 1 (T). Será aprovado o aluno com nota final superior ou igual a 5,0. Média final = PT1x2 + PT2x2 + T / 5 ³ 5
Norma de Recuperação
O exame de recuperação será realizado em data definida no calendário escolar da USP e constará de uma avaliação escrita sobre o conteúdo programático total da disciplina. Serão aprovados os alunos com nota superior ou igual a 5,0 (cinco).
 
Bibliografia
     
Brown, T.A. 2006. Genomes 3 (3rd ed.). Garland Science, New York, NY. 711 pp.
Felsenstein J. 2004. Inferring phylogenies. Sinauer Associates, Inc., Sunderland, Massachusetts, USA.
Futuyma, D.J. 2013. Evolution (3rd ed.). Sinauer Associates, Sunderland, MA. 656 pp.
Graur D., and Li W.-H. 2000. Fundamentals of molecular evolution. Sinauer Associates, Inc, Sunderland, Massachusetts, USA.
Gregory, T.R. (ed.). 2005. The Evolution of the Genome. Elsevier Academic Press, Cambridge, MA. 768 pp.
Matioli S.R. 2001. Biologia Molecular e Evolução. Ed. Holos, Ribeirão Preto, SP, Brasil.
 

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