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Júpiter - Sistema de Gestão Acadêmica da Pró-Reitoria de Graduação


Instituto de Química de São Carlos
 
Disciplinas Interdepartamentais do IQSC
 
Disciplina: 7500144 - Tecnologia do DNA Recombinante
Recombinant DNA Technology

Créditos Aula: 4
Créditos Trabalho: 0
Carga Horária Total: 60 h
Tipo: Semestral
Ativação: 15/07/2022 Desativação:

Objetivos
Apresentar e discutir os fundamentos das principais ferramentas experimentais e computacionais de bioinformáticas envolvidas na tecnologia de DNA recombinante. Fornecer detalhes sobre a estrutura molecular de genes e genomas, e de toda maquinaria envolvida. Discutir as aplicações da tecnologia.
 
Present and discuss the fundamentals of the main experimental and computational tools in bioinformatics involved in recombinant DNA technology. Provide details on the molecular structure of genes and genomes, and all the machinery involved. Discuss technology applications.
 
 
Programa Resumido
Bancos de dados, Fundamentos do sequenciamento de genomas, Técnicas de DNA recombinante e aplicações. Reação em Cadeia da Polimerase – PCR – e variações. Etapas da clonagem de DNA. Organismos geneticamente modificados e Biossegurança. Expressão de proteínas recombinantes em procariotos e em eucariotos. Mutagênese sítio direcionada. Proteínas de fusão. Sistema de duplo híbrido e aplicações. Sistemas de complementação. Parte experimental no laboratório de Informática Química: uso de banco de dados genômicos e de proteínas, análise de sequenciamentos de plasmídeos, reconstrução de segmentos de DNA.
 
Databases, Genome sequencing fundamentals, Recombinant DNA techniques and applications. Polymerase Chain Reaction – PCR – and variations. DNA cloning steps. Genetically Modified Organisms and Biosafety. Expression of recombinant proteins in prokaryotes and eukaryotes. Site-directed mutagenesis. Fusion proteins. Two-hybrid system and applications. Complementation systems. Experimental part in the Chemical Informatics laboratory: use of genomic and protein databases, plasmid sequencing analysis, reconstruction of DNA segments.
 
 
Programa
1. Bancos de dados: NCBI. 2. Técnicas de DNA recombinante: Vetores de clonagem – Plasmídios, Bacteriófagos e Cosmídeos, Vetores de expressão, Enzimas de restrição, DNA ligase, DNA Polimerases, o cDNA, Primers, Bibliotecas genômicas e de cDNA, Sondas. 3. Reação em Cadeia da Polimerase – PCR: PCR em tempo real, RT-PCR, Multiplex PCR, Nested PCR, PCR competitiva. 4. Fundamentos do sequenciamento de genomas: métodos de sequenciamento. 5. Etapas da clonagem. 6. Organismos geneticamente modificados e Biossegurança. 7. Expressão de proteínas recombinantes em procariotos e em eucariotos: vantagens e desvantagens. 8. Mutagênese sítio direcionada. 9. Proteínas de fusão e aplicações em biologia celular e na biotecnologia. 10. Aplicações: Transgênicos, Terapia Gênica, Análise Forense. 11. Parte experimental no laboratório de Informática Química: uso de banco de dados genômicos e de proteínas, análise de sequenciamentos de plasmídeos, reconstrução de segmentos de DNA.
 
1. Databases: NCBI. 2. Recombinant DNA Techniques: Cloning Vectors – Plasmids, Bacteriophages and Cosmids, Expression Vectors, Restriction Enzymes, DNA Ligase, DNA Polymerases, cDNA, Primers, Genomic and cDNA Libraries, Probes. 3. Polymerase Chain Reaction – PCR: Real-time PCR, RT-PCR, Multiplex PCR, Nested PCR, competitive PCR. 4. Fundamentals of genome sequencing: sequencing methods. 5. Cloning steps. 6. Genetically Modified Organisms and Biosafety. 7. Expression of recombinant proteins in prokaryotes and eukaryotes: advantages and disadvantages. 8. Site-directed mutagenesis. 9. Fusion proteins and applications in cell biology and biotechnology. 10. Applications: Transgenics, Gene Therapy, Forensic Analysis. 11. Experimental part in the Chemical Informatics laboratory: use of genomic and protein databases, plasmid sequencing analysis, reconstruction of DNA segments.
 
 
Avaliação
     
Método
Aulas teóricas expositivas e aulas experimentais em laboratório de informática.
Critério
Duas avaliações sendo uma na metade do semestre e outra no final. Seminários em grupo no final do semestre.
Norma de Recuperação
70% de presença e média menor do que 5,0 e maior ou igual a 3,0.
 
Bibliografia
     
Alberts, B. (2011). Biologia Molecular da Célula. 5ª ed. ARTMED Editora Lodish, H. (2014). Biologia Celular e Molecular - 7ª Ed. ARTMED Editora Junqueira e Caneiro, (2012). Biologia Celular e Molecular - 9ª Ed. Guanabara Koogan Watson, J.D. (2009). DNA Recombinante. Genes e Genomas, 3ª Ed. ARTMED Editora Voet, D., Voet, J.G. Bioquímica (2013). 4º ed. ARTMED Editora
 

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