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Júpiter - Sistema de Graduação

Instituto de Biociências
 
Genética e Biologia Evolutiva
 
Disciplina: BIO0454 - Introdução à Programação de Computadores para Biologia
Introduction to Computer Programming for Biology

Créditos Aula: 2
Créditos Trabalho: 2
Carga Horária Total: 90 h
Tipo: Semestral
Ativação: 15/07/2016 Desativação:

Objetivos
Apresentar conceitos básicos de desenvolvimento de algoritmos e sua representação em linguagem de alto nível. Capacitar o aluno no uso da linguagem Perl. Promover o desenvolvimento e implementação de programas e sua aplicação na resolução de problemas biológicos.
 
 
 
Docente(s) Responsável(eis)
7339675 - Tatiana Teixeira Torres
 
Programa Resumido
Introdução a teoria de algoritmos. Programação em Perl voltada à resolução de problemas biológicos.
 
 
 
Programa
Teórico: Conceitos básicos em programação de computadores (algoritmos, linguagens de programação, compiladores e interpretadores) e desenvolvimento de algoritmos. Introdução ao UNIX e à linguagem Perl. Tipos de dados e variáveis, declaração, estruturas de controle, expressões regulares e funções (bloco de comandos e passagem de parâmetros). Utilização de módulos (CPAN e Bioperl). Prático: Implementação de aplicações simples para manipulação de dados biológicos, com ênfase em manipulação de sequências
 
 
 
Avaliação
     
Método
A avaliação da disciplina será realizada mediante duas provas escritas (P1, P2) e um trabalho de conclusão. O trabalho será desenvolvido no decorrer do semestre e consistirá de uma aplicação desenvolvida pelo aluno para resolver um problema proposto no início da disciplina.
Critério
A nota final será calculada pela média ponderada das notas obtidas pelo aluno nas duas provas e no trabalho final.
Norma de Recuperação
Não há.
 
Bibliografia
     
Livro Texto:
- Wall, L.; Christiansen, T.; Orwant, J. “Programming Perl”, O'Reilly Media, 2000.

Bibliografia Complementar:
- Tisdall, J. “Beginning Perl for Bioinformatics”, ”, O'Reilly Media, 2001.
- Setubal J. C.; Meidanis J. "Introduction to Computational Molecular Biology", Brooks/Cole Pub Co, 1997.
 

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