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Júpiter - Sistema de Gestão Acadêmica da Pró-Reitoria de Graduação


Instituto de Ciências Biomédicas
 
Parasitologia
 
Disciplina: BMP0216 - Bioinformática e Genômica
Bioinformatics and Genomics

Créditos Aula: 4
Créditos Trabalho: 0
Carga Horária Total: 60 h
Tipo: Semestral
Ativação: 01/01/2015 Desativação:

Objetivos
• Transmitir ao aluno o conceito de análise in silico
• Transmitir os conceitos gerais de Genômica, incluindo estrutura física, organização gênica e aspectos evolutivos;
• Apresentar os principais métodos e ferramentas de Bioinformática para a análise de sequências biológicas;
• Apresentar algumas das bases de dados de dados genômicos e ferramentas de análise em web.
 
 
 
Docente(s) Responsável(eis)
2796430 - Arthur Gruber
763756 - João Marcelo Pereira Alves
1780910 - Robson Francisco de Souza
 
Programa Resumido
• Conceitos gerais de genômica e análise in silico de dados biológicos, apresentação dos principais métodos e ferramentas de Bioinformática para a análise de sequências biológicas, bases de dados de dados genômicos e ferramentas de análise em web.
 
 
 
Programa
Teórico
Anatomia de genomas: estrutura física e organização gênica de genomas;
Conceitos básicos de genômica e bioinformática;
Introdução ao sistema Linux;
Buscas de similaridade – conceito e aplicações;
Motivos proteicos: abordagens e aplicações;
Montagem de sequências de DNA;
Conceitos de anotação de genomas e transcritos;
Bases de dados de ortologia e vias metabólicas;
Anotação integrada de genomas e transcritos: sistemas de pipelines;
Evolução molecular;
Introdução à análise filogenética;
RNA-Seq;
Microarranjos;
Biologia de sistemas.

Prático:
Treinamento no computador com os principais programas de Bioinformática abordados
 
 
 
Avaliação
     
Método
Aulas expositivas teóricas com recursos audiovisuais e aulas práticas em laboratório de Bioinformática para treinamento com os principais programas de Bioinformática abordados no programa da disciplina. Haverá um sítio web com material didático complementar, incluindo arquivos de artigos, tutoriais e links para portais para os mais importantes programas de Bioinformática.
Critério
O corpo discente terá como atividades a leitura de artigos e/ou capítulos de livros e a execução de exercícios para análise de seqüências de DNA e proteínas usando programas de computador.A avaliação do aprendizado do corpo discente será realizada através de provas teóricas e exercícios de anotação de seqüências.
Norma de Recuperação
Será oferecida prova de recuperação (Res. COG 3583/89) nos meses de julho para as disciplinas do 1o semestre e em fevereiro para as disciplinas do 2o semestre, exigindo-se média igual ou superior a 5,0 (cinco) para aprovação.
 
Bibliografia
     
• Agostino, M. (2012). Practical Bioinformatics. Garland Science, 1st edition, USA.

• Baxevanis, A.D. & Ouellette, B.F.F. (2005). Bioinformatics: A Practical Guide to the Analysis of Genes and Proteins. 3rd edition. John Wiley & Sons, Inc., New York, USA.

• Brown, S.M. (2013). Next-Generation DNA Sequencing Informatics. Cold Spring Harbor Laboratory Press, 1st edition, USA.

• Brown, T.A. (2006). Genomes 3. Garland Science, 3rd edition, USA.

• Lesk, A.M. (2012). Introduction to Genomics. Oxford University Press, 2nd edition, USA.

• Lesk, A.M. (2014). Introduction to Bioinformatics. Oxford University Press, 4th edition, USA.

• Mount, D.W. (2004). Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis. 2nd edition. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, USA.

• Pevzner, P. & Shamir, R. (2011). Bioinformatics for Biologists. Cambridge University Press, 1st edition, UK.
 

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