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Júpiter - Sistema de Gestão Acadêmica da Pró-Reitoria de Graduação


Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
 
Disciplinas Interdepartamentais
 
Disciplina: RIB0307 - Métodos da Bioinformática
Methods in Bioinformatics

Créditos Aula: 4
Créditos Trabalho: 0
Carga Horária Total: 60 h
Tipo: Semestral
Ativação: 01/01/2019 Desativação:

Objetivos
Dotar os alunos de conhecimentos básicos sobre técnicas e métodos sofisticados aplicados em diversas sub-áreas da Bioinformática. É um objetivo primário complementar a formação dos estudantes para além do introdutório, apresentado até este ponto do currículo, e prepará-los para as atividades práticas de laboratório, que serão apresentadas após este ponto no currículo e na prática profissional futura.
 
 
 
Programa Resumido
Distribuições e Densidades de Probabilidade comuns em Bioinformática; Significância Estatística aplicada à Bioinformática; Associação Estatística em Bioinformática; Noções de Inferência Bayesiana; Redes Bayesianas em Bioinformática; Modelo Oculto de Markov (''Hiden Markov Models'') em Bioinformática; Noções de Classificadores aplicados à Bioinformática; Técnicas de Agrupamento (''Clustering'') comuns em Bioinformática.
 
 
 
Programa
Distribuições e Densidades de Probabilidade comuns em Bioinformática; Significância Estatística aplicada à Bioinformática; Associação Estatística em Bioinformática; Noções de Inferência Bayesiana; Redes Bayesianas em Bioinformática; Modelo Oculto de Markov (''Hiden Markov Models'') em Bioinformática; Noções de Classificadores aplicados à Bioinformática; Técnicas de Agrupamento (''Clustering'') comuns em Bioinformática.
 
 
 
Avaliação
     
Método
Aulas teóricas complementadas com exemplos e exercícios propostos.
Critério
Serão atribuídas notas a exercícios e/ou trabalhos práticos e provas. A nota final será calculada pela média ponderada dessas várias notas obtidas pelo aluno no decorrer do semestre.
Norma de Recuperação
O aluno será aprovado se apresentar ao final do semestre uma média igual ou superior a cinco (5,0) e no mínimo 70% de presença. A recuperação será aplicada aos alunos que tiverem apresentado no mínimo 70% de presença e média parcial entre 3,0 e 4,9. A recuperação será constituída de uma avaliação escrita abrangendo todo o conteúdo da disciplina. A nota final, nestes casos, será a média aritmética da nota de recuperação e daquela obtida durante o semestre. O período de recuperação será conduzido dentro do prazo regimental, antes do início do próximo semestre letivo.
 
Bibliografia
     
1. Pevzner PA. Educating biologists in the 21st century: bioinformatics scientists versus bioinformatics technicians. 1: Bioinformatics. 2004 Sep 22;20(14):2159-61. Epub 2004 Apr 8.
2. Wikipédia, a enciclopédia livre (http://pt.wikipedia.org/ e http://en.wikipedia.org/)
3. Recursos educacionais diversos do NCBI (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Education/)
4. Brent MR. Steady progress and recent breakthroughs in the accuracy of automated genome annotation. 1: Nat Rev Genet. 2008 Jan;9(1):62-73.
5. Eddy SR. What is a hidden Markov model? Nature Biotechnology 22, 1315 - 1316 (2004) 
6. Needham CJ, Bradford JR, Bulpitt AJ, Westhead DR. A primer on learning in Bayesian networks for computational biology. 1: PLoS Comput Biol. 2007 Aug;3(8):e129.
7. Saeys Y, Inza I, Larrañaga P. A review of feature selection techniques in bioinformatics. 1: Bioinformatics. 2007 Oct 1;23(19):2507-17.
8. Notredame C (2007) Recent Evolutions of Multiple Sequence Alignment Algorithms. PLoS Comput Biol 3(8): e123. 
9. Tarca AL, Carey VJ, Chen X-w, Romero R, Drăghici S (2007) Machine Learning and Its Applications to Biology. PLoS Comput Biol 3(6): e116.
10. Punta M, Ofran Y (2008) The Rough Guide to In Silico Function Prediction, or How To Use Sequence and Structure Information To Predict Protein Function. PLoS Comput Biol 4(10): e1000160.
 

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