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Júpiter - Sistema de Gestão Acadêmica da Pró-Reitoria de Graduação


Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto
 
Disciplinas Interdepartamentais
 
Disciplina: RIB1029 - Introdução à Bioinformática
Introduction to Bioinformatics

Créditos Aula: 4
Créditos Trabalho: 0
Carga Horária Total: 60 h
Tipo: Semestral
Ativação: 01/01/2020 Desativação:

Objetivos
Dotar os alunos de conhecimentos básicos sobre a aplicação da informática na análise dos processos biológicos a partir de dados de seqüência de DNA, seqüência de proteínas e de expressão gênica.
 
 
 
Docente(s) Responsável(eis)
1689081 - Silvana Giuliatti
 
Programa Resumido
Formatos de arquivos, alinhamentos de sequências, filogenia, predições de estruturas, analise de expressão gçenica.
Obtenção de Seqüências, Bancos de dados genômicos e formato de arquivos.
-Phred/Phrap
-Alinhamento de Pares de Seqüências
-Alinhamento Múltiplos de Seqüências
-Árvores Filogenéticas
-Predição de Estrutura Secundária de RNA
-Predição de Genes e transcriptoma
-Classificação de Proteínas
-Predição de Estruturas
-Medida de Expressão Gênica
-Análise de Genomas
-Conceito de Pipeline
 
 
 
Programa
-Obtenção de Seqüências, Bancos de dados genômicos e formato de arquivos.
-Phred/Phrap
-Alinhamento de Pares de Seqüências
-Alinhamento Múltiplos de Seqüências
-Árvores Filogenéticas
-Predição de Estrutura Secundária de RNA
-Predição de Genes e transcriptoma
-Classificação de Proteínas
-Predição de Estruturas
-Medida de Expressão Gênica
-Análise de Genomas
-Conceito de Pipeline
 
 
 
Avaliação
     
Método
Estudos dirigidos via E-disciplinas, desenvolvimento de projeto com apresentação de relatórios e seminários. Média ponderada: estudos dirigidos peso 03, seminário parcial peso 02, relatório parcial peso 01, seminário final peso 02, relatório final peso 02.
Critério
-Média ponderada das notas de provas e atividades/seminários, sendo que o peso de cada prova é 4 e seminários/atividades com peso 2.
Norma de Recuperação
-O aluno será aprovado se apresentar ao final do semestre uma média igual ou superior a cinco (5,0) e no mínimo 70% de presença. -A recuperação será aplicada aos alunos que tiverem no mínimo 70% de presença e será constituída de uma avaliação escrita de todo o conteúdo abordado durante o semestre. -A nota final, nestes casos, será a média aritmética da nota de recuperação e daquela obtida durante o semestre. -O período de recuperação será conduzido dentro do prazo regimental, antes do início do próximo semestre letivo.
 
Bibliografia
     
-Mount, D. W., Bioinformatics: sequence and genome analysis. O´REILLY, 2001.
-Gibas, C. And Jambbeck, P., Developing Bioinformatics computer skilss . 2001.
-Claverie, J.M. e Notredame, C., Bioinformatics for Dummies, ed. Wiley, 2002.
 

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