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Júpiter - Sistema de Graduação

Instituto de Ciências Matemáticas e de Computação
 
Ciências de Computação
 
Disciplina: SCC0271 - Introdução à Bioinformática
Introduction to Bioinformatics

Créditos Aula: 3
Créditos Trabalho: 2
Carga Horária Total: 105 h
Tipo: Semestral
Ativação: 01/01/2011 Desativação:

Objetivos
O aprendizado dos conceitos básicos, principais técnicas, perspectivas futuras e aplicações de Bioinformática.
 
Introduce students to the techniques, theories and models used in Bioinformatics, allowing the development of models, tools and computer applications involving the application of Computing to solve problems in biology and medicine, as well as to perform research in the area.
 
 
Programa Resumido
O aprendizado dos conceitos básicos, principais técnicas, perspectivas futuras e aplicações de Bioinformática.
 
To provide to students interested in the area, an overview of typical problems and solutions relevant in Bioinformatics.
 
 
Programa
Biologia molecular, Análise de seqüências, Reconhecimento de genes, Alinhamento de seqüências, Uso de cadeias de Markov em dados biológicos, Variação dentro e entre espécies, Seleção natural em nível molecular, Análise filogenética, Comparação de genomas, Análise de expressão gênica, Identificação de seqüências regulatórias, Aplicações.
 
Review and analysis of molecular biology sequences. Ontologies in Bioinformatics, Annotation, Gene Ontology. Gene Recognition. Sequence Alignment. Variation within and between species. Natural Selection at Molecular Level. Phylogenetic Analysis. Comparison of Genomes. Analysis of Gene Expression. Identification of regulatory sequences. Repositories and Tools Available on the Web
 
 
Avaliação
     
Método
Exposição seguida de exercícios e trabalhos práticos, executados alguns em classe e outros fora de classe. A nota final será calculada pela média ponderada dessas várias notas obtidas pelo aluno no decorrer do semestre.
Critério
Serão atribuídas notas a provas e/ou trabalhos práticos. A nota final será calculada pela média ponderada das notas obtidas pelo aluno no decorrer do semestre.
Norma de Recuperação
-Critério de Aprovação: NP+(Mrec/2,5), se Mrec > ou =7,5; ou Max {NP,Mrec}, se Mrec < ou = 5,0; ou 5,0, se 5,0 < ou = Mrec < 7,5.( NP=1ª avaliação, Mrec=prova)
 
Bibliografia
     
· Livro Texto:
- Nello Cristianini, N.; Hahn, M. “Introduction to Computational Genomics: A Case Studies Approach”, Cambridge, 2007.

· Bibliografia Complementar:
- Jones, J.; Pevzner:, P. “An Introduction to Bioinformatics Algorithms”, MIT Press, 2004.
- Setubal J. C.; Meidanis J. "Introduction to Computational Molecular Biology", Brooks/Cole Pub Co, 1997.
- Lesk, A. “Introdução a Bioinfromática”, Artmed, 2007.
- Wu, C.; McLarty, J. “Neural Networks and Genome Informatics”, Elsevier, 2000.
- Jagota, A. "Data Analysis and Classification for Bioinformatics", Bioinformatics By The Bay Press, 2000.
- Mount, D. "Bioinformatics: Sequence and Genome Analysis", Cold Spring Harbor Laboratory, 2001.
 

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