Desenvolver a pequisa científica na graduação utilizando conhecimentos de farmacologia e bioquímica para entender o funcionamento e o desenvolvimento de novos fármacos.
Estudo de alvos terapêuticos atuais com seu ligante (fármaco) e análise da estrutura tridimensional de proteínas como potenciais alvos terapêuticos em estudo.
Estrutura tridimensional de proteínas; Banco de dados de raio X de proteínas; Manipulação de estruturas proteicas; Modelagem molecular de proteínas; Alinhamento tridimensional de proteínas; Enzimas como alvo terapêutico; Inibidores enzimáticos utilizados na terapêutica; Banco de dados de pequenas moléculas candidatas a novos fármacos; Simulação da interação de proteína alvo com ligantes (drogas naturais e sintéticas).
Bibliografia Básica: [1] Mochly-Rosen, D., Das, K., and Grimes, K. V. (2012) Protein kinase C, an elusive therapeutic target?, Nature Reviews Drug Discovery 11, 937. [2] Garbers, C., Heink, S., Korn, T., and Rose-John, S. (2018) Interleukin-6: designing specific therapeutics for a complex cytokine, Nature Reviews Drug Discovery. [3] Rautio, J., Meanwell, N. A., Di, L., and Hageman, M. J. (2018) The expanding role of prodrugs in contemporary drug design and development, Nature Reviews Drug Discovery. [4] Nwaka, S., and Hudson, A. (2006) Innovative lead discovery strategies for tropical diseases, Nature Reviews Drug Discovery 5, 941. [5] McKerrow, J. H., and Lipinski, C. A. (2017) The rule of five should not impede anti-parasitic drug development, International Journal for Parasitology: Drugs and Drug Resistance 7, 248-249. Bibliografia Complementar: [1] ALTSCHUL, S. F.; LIPMAN, D. J. Protein database searches for multiple alignments. Proc Natl Acad Sci USA. v.87, n.14, 5509-5513, 1990. [2] ALTSCHUL, S. F.; GISH, W.; MILLER, W.; MYERS, E.W.; LIPMAN, D. J. Basic local alignment search tool. J Mol Biol. v.215, n.3, 403-410, 1990. [3] ALTSCHUL, S. F.; MADDEN, T. L.; SCHÄFFER, A. A. et al. Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search programs. Nucleic Acids Res. v.25, n.17: 3389-33402, 1997. [4] LANG, P. T.; BROZELL, S. R.; MUKHERJEE, S. et al. DOCK 6: combining techniques to model RNA-small molecule complexes. RNA. v.15, n.6: 1219- 1230, 2009. [5] PETTERSEN, E. F.; GODDARD, T. D.; HUANG, C. C. et al. UCSF Chimera--a visualization system for exploratory research and analysis. J Comput Chem. v.25, n.13:1605-1612, 2004. [6] 'THOMPSON, J. D.; HIGGINS, D. G.; GIBSON, T. J. CLUSTAL W: choice. Nucleic Acids Res. v.11, n.22, 4673-4680, 1994.
